Ganzgenomsequenzierung im Bereich der Lebensmittelsicherheit: Stand der Dinge

Die EFSA hat zwei Berichte veröffentlicht, die ein Bild davon vermitteln, wie Ganzgenomsequenzierung Bildliche Darstellung der gesamten genetischen Ausstattung (Erbgut) eines bestimmten Organismus (Whole Genome Sequencing – WGS) im Bereich der Lebensmittelsicherheit angewendet werden kann und in welchem Umfang solche Techniken in Europa bereits eingesetzt werden.

WGS findet zunehmend Verwendung in Laboratorien des öffentlichen Gesundheitswesens und Labors für Lebensmittelsicherheit, wird jedoch in verschiedenen Ländern zu verschiedenen Zwecken und auf unterschiedliche Weise eingesetzt.

Erhebung zum Einsatz von WGS

Eine von der EFSA und der Europäischen Kommission im Jahr 2016 durchgeführte Erhebung zum Einsatz von WGS für durch Lebensmittel und Wasser übertragbare Krankheitserreger aus Tieren, Lebens- und Futtermitteln sowie deren Umwelt in EU/EFTA-Ländern ergab u.a. Folgendes:

• Bis Ende 2016 wurde WGS bereits in 17 von 30 Ländern zu Laborzwecken eingesetzt.

• Der Hauptgrund für den Nicht-Einsatz von WGS liegt in mangelndem Know-how und fehlenden finanziellen Mitteln.
• WGS wurde hauptsächlich als Hilfsmittel zur Untersuchung von Krankheitsausbrüchen eingesetzt.

ENGAGE-Projekt

Der Abschlussbericht eines Projekts zur Schaffung von Kapazitäten für die nächste Generation der DNA Komplexes, kettenähnliches Molekül, das in allen Lebewesen und einigen Viren vorkommt und die genetischen Informationen (Gene) trägt. Die DNA (dt.: Desoxyribonukleinsäure – DNS) ist in der Lage, sich selbst zu kopieren, und enthält die „Baupläne“ aller Proteine, die für die Schaffung und Erhaltung von Leben notwendig sind-Sequenzierung zur Genomanalyse in Europa („Establishing next generation sequencing ability for genomics analysis in Europe“ – ENGAGE) enthält eine Beschreibung aller bislang erreichten Meilensteine. Hierzu zählen etwa Veröffentlichungen von bakteriellen Sequenzen, wissenschaftliche Publikationen, Benchmarking-Aktivitäten, Workshops, Schulungen und E-Learning-Materialien.

Ziel des von der EFSA kofinanzierten Projekts war es, die wissenschaftliche Zusammenarbeit zwischen europäischen Labors beim Einsatz von WGS im Bereich der Lebensmittelsicherheit und zum Schutz der öffentlichen Gesundheit zu fördern.

Alle erstellten Materialien finden sich im Bericht sowie auf der ENGAGE-Website.